Karl G. Hofbauer war am Biozentrum von 2000 bis 2011 als Professor für Angewandte Pharmakologie tätig. Seine Lehrtätigkeit umfasste den Unterricht von Medizinstudenten und die Umstellung dieses Studiums auf das Bachelor/Master System. Seine wissenschaftlichen Arbeiten betrafen neben allgemeinen pharmakologischen Themen vor allem Störungen des Energiehaushalts mit Fokus auf neue Konzepte für Diagnose und Therapie. Von 2001 bis 2003 war Hofbauer Präsident der Schweizerischen Gesellschaft für Pharmakologie und Toxikologie.